Генетический анализатор «Нанофор-05» появился в НИИ биологии Иркутского государственного университета. Прибор определяет последовательность нуклеотидов в исследуемом гене, а именно секвенирует ДНК по методу Сэнгера.
Важная особенность этого метода -- высокая точность при чтении последовательностей ДНК, которая остается недоступной для технологий секвенирования второго и третьего поколения, используемых в современных полногеномных исследованиях. Подобная точность необходима в генной инженерии, а также для определения видовой принадлежности животных, растений и микроорганизмов по филогенетическим генам-маркерам.
Сотрудники НИИ биологии ИГУ прошли трехдневный мастер-класс по использованию всех возможностей нового генетического анализатора.
«Обучение работе на этом секвенаторе было очень обстоятельным и, можно сказать, плодотворным. С помощью нового прибора в рамках моей магистерской диссертации уже получены первые данные о популяционной структуре байкальских амфипод, расселившихся в реке Ангара. Мы надеемся, что это лишь первый небольшой шаг на пути более глубокого понимания эволюционных процессов, которые прямо сейчас происходят в озере Байкал и Байкальском регионе», -- прокомментировала младший научный сотрудник НИИ биологии и магистрантка биолого-почвенного факультета ИГУ Александра Саранчина.
Новый генетический анализатор будет использоваться и в образовательном процессе.
«Главное изменение, которое привнесет для нас Нанофор-05, -- это значительное ускорение многих проводимых работ. В последние годы в нашем институте активно используются процедуры генной инженерии микроорганизмов, причем не только для биотехнологических разработок, но и для изучения работы отдельных белков эндемиков озера Байкал. Эти процедуры требуют проведения секвенирования по Сэнгеру на различных этапах, поэтому необходимость в отправке образцов в сторонние организации могла замедлять рутинные операции, порой, на недели. Наличие секвенатора непосредственно на базе Института биологии принципиально меняет ситуацию», -- поделилась ведущий научный сотрудник НИИ биологии ИГУ, одна из операторов нового прибора Полине Дроздовой.
